Thứ nhất, về cơ chế, chính sách, Thanh tra Chính phủ kiến nghị Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo: Bộ Công thương rà soát, xem xét việc xếp loại doanh nghiệp đối với 31 công ty xăng dầu thành viên có vi phạm trong việc chấp hành pháp luật thuế năm 2010, 2011 theo đúng quy định.
Yêu cầu Bộ Tài chính xác định, truy thu thuế đói với 319,5 tấn dầu diesel do Công ty Xăng dầu Khu vực III bán tái xuất cho các doanh nghiệp trong khu công nghiệp Nomuara - Hải Phòng không đúng đối tượng.
Đồng thời, Bộ Tài chính cần xem xét, quy định chế độ hạch toán kế toán đối với việc bán xăng dầu theo hình thức "hợp đồng đại lý bao tiêu" để quản lý chặt chẽ, minh bạch giá bán và chi phí thù lao cho các tổng đại lý, đại lý kinh doanh xăng dầu.
Đối với tập đoàn xăng dầu Việt Nam, TTCP kiến nghị Thủ tướng chỉ đạo đơn vị này sửa đổi, bổ sung Quy chế kinh doanh xăng dầu và các định mức kinh tế - kỹ thuật về quản lý xăng dầu. Xây dựng, ban hành quy chế, quy định về quản lý bán hàng tại các thời điểm điều chỉnh giá, quản lý xăng dầu tồn kho, quản lý thù lao tổng đại lý, đại lý bán xăng dầu.
Thứ hai, về xử lý kinh tế, yêu cầu Tập đoàn xăng dầu Việt Nam, các công ty xăng dầu thành viên và các công ty liên quan thực hiện các nội dung sau:
- Trích bổ sung Quỹ bình ổn giá 4,8 tỷ đồng, xác định lại số tiền đã trích lập dự phòng giảm giá đầu tư tài chính chưa đúng quy định 53,7 tỷ đồng.
- Thực hiện nghĩa vụ tài chính về thuế TNDN, phân bổ chi phí sử dụng vốn vào giá trị công trình 23,2 tỷ đồng, thoái vốn đầu tư ngoài ngành nghề kinh doanh chính theo chủ trương Chính phủ và chỉ đạo của TTCP, trong đó đầu tư chưa đúng quy định 622,3 tỷ đồng, xây dựng lộ trình thu hồi các khoản đã ủy thác cho vay đầu tư xây dựng 414,6 tỷ đồng.
- Có biện pháp thu hồi các khoản: Công nợ phát sinh do bán tái xuất xăng dầu 278 nghìn USD, ký hợp đồng chuyển tiền mua đất trái thẩm quyền 540 triệu đồng,
- Chấm dứt việc thực hiện chi 3 tháng lương cho người lao động trước khi nghỉ hưu, dừng thực hiện ủy thác cho các đơn vị thành viên vay đầu tư xây dựng khi không bố trí được nguồn vốn, xử lý dứt điểm khoản treo công nợ phải thu nội bộ từ các công ty xăng dầu thành viên do đánh giá lại giá trị tài sản.
Thứ ba, về xử lý trách nhiệm, TTCP yêu cầu Bộ Công thương chủ trì, chỉ đạo tập đoàn xăng dầu Việt Nam kiểm điểm, xử lý trách nhiệm theo quy định của pháp luật đối với tập thể, cá nhân thuộc tập đoàn và các công ty liên quan đến những khuyết điểm, vi phạm trong việc quản lý, sử dụng vốn, tài sản, quản lý hoạt động kinh doanh.
Đồng thời, Bộ công an tiếp nhận hồ sơ để điều tra, xử lý theo quy định của pháp luật đối với 2 vụ việc xảy ra giữa Công ty Vipco và Công ty Thiên Lộc Phú.