Theo quy định tại Nghị định 123/2020/NĐ-CP, doanh nghiệp, tổ chức kinh tế đã thông báo phát hành hóa đơn đặt in, hóa đơn tự in, hóa đơn điện tử không có mã của cơ quan thuế hoặc đã đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế, đã mua hóa đơn của cơ quan thuế trước ngày 19/10/2020 thì được tiếp tục sử dụng hóa đơn đang sử dụng kể từ 19/10/2020 đến hết ngày 30/6/2022.
Trường hợp từ ngày 19/10/2020 đến ngày 30/6/2022, trường hợp cơ quan thuế thông báo cơ sở kinh doanh chuyển đổi để áp dụng hóa đơn điện tử, nếu cơ sở kinh doanh chưa đáp ứng điều kiện về hạ tầng công nghệ thông tin mà tiếp tục sử dụng hóa đơn giấy thì cơ sở kinh doanh thực hiện gửi dữ liệu hóa đơn đến cơ quan thuế theo mẫu cùng với việc nộp tờ khai thuế giá trị gia tăng.
Cơ quan thuế xây dựng dữ liệu hóa đơn của các cơ sở kinh doanh để đưa vào cơ sở dữ liệu hóa đơn và đăng tải trên Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế phục vụ việc tra cứu dữ liệu hóa đơn.
Ngoài ra, Nghị định số 123/2020/NĐ-CP cũng quy định rõ, đối với cơ sở kinh doanh mới thành lập trong thời gian từ ngày 19/10/2020 đến này 30/6/2022, trường hợp cơ quan thuế thông báo cơ sở kinh doanh thực hiện áp dụng hóa đơn điện tử thì cơ sở kinh doanh thực hiện theo hướng dẫn của cơ quan thuế.
Nghị định số 123/2020/NĐ-CP cũng đã bãi bỏ khoản 2 Điều 35 Nghị định số 119/2018/NĐ-CP ngày 12/9/2018 của Chính phủ quy định về hóa đơn điện tử.
Khoản 2 Điều 35 Nghị định số 119/2018/NĐ-CP nêu: Việc tổ chức thực hiện hóa đơn điện tử, hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế theo quy định thực hiện xong đối với các doanh nghiệp, tổ chức kinh tế, tổ chức khác, hộ, cá nhân kinh doanh chậm nhất là ngày 1/11/2020.
Như vậy, theo quy định mới thì từ ngày 1/11/2020, chưa bắt buộc doanh nghiệp phải sử dụng hoá đơn điện tử.
Quy định mới tại Nghị định 123/2020/NĐ-CP được cho là đã giải tỏa lo lắng của doanh nghiệp.
Bởi thời gian gần đây, trong việc thực hiện việc sử dụng hóa đơn điện tử, cơ quan thuế mỗi nơi hướng dẫn mỗi kiểu, khiến doanh nghiệp không biết việc "khai tử" hóa đơn giấy để chuyển sang sử dụng hóa đơn điện tử từ ngày 1/11/2020, theo quy định của Nghị định 119, hay từ ngày 1/7/2022, theo quy định của Luật Quản lý thuế.
Trong khi trả lời các doanh nghiệp, cơ quan thuế nhiều địa phương hướng dẫn "nước đôi" và yêu cầu doanh nghiệp chờ nghị định hướng dẫn thực hiện Luật Quản lý thuế mới.