Với một năm học gồm 10 tháng, mức học phí của học sinh theo học tại trường song ngữ quốc tế Newton Hà Nội tăng dần theo các cấp học. Cụ thể, học phí các lớp trong trường dao động trong khoảng 38.000.000 - 137.000.000 đồng/năm tùy thuộc lớp học và hệ đào tạo.
Với 2 hệ học chính bao gồm: Hệ Bán quốc tế Edexcel School (Anh) và Hệ song ngữ GW (Mỹ), học phí hệ song ngữ các lớp từ 1-5 chênh lệch so với hệ Bán quốc tế không nhiều. Từ lớp 6 - 12, học phí lớp hệ song ngữ cao gấp gần 3 lần so với hệ Bán quốc tế. Cụ thể như sau:
| LỚP | Hệ Bán quốc tế (vnđ/ năm) | Hệ song ngữ GW(MỸ) (vnđ/năm) |
| Lớp 1 - 2 | 38.000.000 | 49.000.000 |
| Lớp 3 - 4 - 5 | 40.000.000 | 65.000.000 |
| Lớp 6 - 7 - 8 | 49.000.000 | 119.000.000 |
| Lớp 9 - 10 | 51.000.000 | 127.000.000 |
| Lớp 11 - 12 | 53.000.000 | 137.000.000 |
Bên cạnh đó là các mức phí khác như phí xe đưa đón, phí dự tuyển, đồng phục,... dao động khoảng trên dưới 60 triệu/năm.
