UNIS là trường được thành lập bởi Liên Hiệp Quốc và Chính phủ Việt Nam nên nhà trường ưu tiên cho những học sinh có người thân làm việc cho Liên Hiệp Quốc, làm việc trong ngành ngoại giao và các gia đình người nước ngoài. UNIS cũng ưu tiên cho những gia đình có con đã theo học tại trường.
Đối với cấp mẫu giáo, trường nhận học sinh từ 2 tuổi trở lên. Học phí hệ mầm non dao động từ 14,6 - 17,5 nghìn USD/năm (khoảng 334 - 400 triệu đồng), học phí lớp 9 - 10 là 25,3 nghìn USD (hơn 570 triệu đồng), lớp 11 - 12 là 27,1 nghìn USD (khoảng 619 triệu đồng).
BẢNG HỌC PHÍ TẠI TRƯỜNG UNIS
| Hệ/Lớp học | Học phí tính theo năm (USD) | Quy đổi ra VNĐ |
| Học nửa ngày (ngày học tính đến 12h trưa) | 7,900 | 180,120,000 |
| Học cả ngày (Ngày học đến 15h20 ngoại trừ Thứ 4) | 11,500 | 262,200,000 |
| Mẫu giáo 1 | 14,665 | 334,362,000 |
| Mẫu giáo 2 | 18,350 | 418,380,000 |
| Lớp 1 -5 | 22,230 | 506,844,000 |
| Lớp 6- 8 | 23,700 | 540,360,000 |
| Lớp 9 - 10 | 25,370 | 578,436,000 |
| Lớp 11 - 12 | 27,150 | 619,020,000 |
Bên cạnh đó, các vị phụ huynh còn phải đóng một số loại phí khác như phí nhập học, phí xe bus đưa đón, phí đặt cọc,... tùy theo cấp học và nhu cầu sử dụng dịch vụ.
